与廖承志､祝志澄谈完后，恰巧中央军委铁道部部长滕代远､副部长兼铁路护运司令员吕正操､东北野战军铁路纵队司令员兼东北铁路修复局局长黄逸峰等三人来到了西柏坡。从石家庄到北平的铁路线此时已经被我方掌握，因此“大搬家”将动用铁路运输力量。在那些天里，杨尚昆几次同他们碰头商议铁路的运输及安全等问题。
2月1日下午，即将奔赴北平的李克农又来到杨尚昆处，与他商议大搬迁的先遣工作。杨尚昆对李克农感慨道:“自延安从李富春同志手中接过中央办公厅的领导之责起，3年来均在‘搬’与‘安’二字上工作。而此次移动则大有不同:一，由农村到城市(而且是大城市);二，时局正在最紧张的关头，不如延安的偏安，也不如三交时之安宁，指挥工作是一刻也不能中断的;三，北平是局部和平而得解放者，未经清洗，一切微生物(中外的)都很多，应当引起最高的警惕。”杨尚昆所说的“微生物”，是指部署､残留和流窜到北平的隶属不同系统和方面的敌特人员。
不久前，赴北平作了一番勘察的范离已经返回西柏坡，并将他在北平勘察驻地的情况向杨尚昆作了汇报。他总的感觉是，北平城里的情况比较复杂。北平方面也认为，中央机关如果一进北平就驻扎城内，安全警戒条件不成熟。听完范离汇报后，杨尚昆与邓典桃等人又作过一些商量。
长期主管特情工作的李克农，通过自己的系统对北平的复杂情况已经有所掌握。他告诉杨尚昆，北平是国民党华北“剿总”的所在地，原来就特务机构林立:有国民党政府的国防部保密局､二厅､党统局，华北“剿总”二处，阎锡山的特务系统，还有美英的国际间谍，有多达八个系统的特务。另外，随着西北战事的推进，辽沈､平津战役的胜利，从东北､华北和西北也有大量特务流窜到北平潜伏､暗藏下来，很难在短时间里查清楚。特别是北平是和平解放的，国民党在北平的党政军机关虽然被我方军管或宣布解散，但社会政治环境一时还来不及清理。
杨尚昆和李克农都感觉到，清理出一个局部比较安全的环境，是中央机关进驻北平前的一项重要工作。因此两人很快达成共识，中央机关到北平后，起码在一段时间里不宜驻扎在城里。
杨尚昆把周恩来介绍的两个人安排到李克农那里/李克农与叶剑英､彭真商讨后，认为香山可作为中央机关进北平后的临时驻地/老警卫吴烈率一六○师再次担起保卫党中央的重任
2月1日晚，杨尚昆和李克农一起到周恩来的办公处，将他们议论和已经形成的共识作了汇报。他们在谈论中一致认为，中央机关的此次大搬迁和安置，是一项不同以往的重大政治任务，一定要做到万无一失。周恩来对中央机关进北平后“驻地暂放在城郊为好”的设想表示同意。随后，他确定李克农于2月3日动身去北平，以加强北平清理敌特和迎接中央机关的准备工作。
为了协助李克农在北平的工作，杨尚昆决定让中共中央书记处特别会计科科长赖祖烈､中直供给部副部长范离随李克农一同前往北平。2月2日，杨尚昆和李克农､赖祖烈､范离一起，对他们到北平后要办的各项事宜､如何更好地协调又作了详细研究。
这一天，周恩来介绍了两个人给杨尚昆，杨尚昆随即安排他俩到李克农那里报到。这两人一个是专门从事扫雷工作的，一个是搞无线电专业的。杨尚昆要他俩随李克农到北平，参与中央机关驻地的安全检查工作。为了驻扎地的安全，要对驻扎地可能隐藏的爆炸物及窃听装置进行仔细､全面的探查和清除。
在随后的几天里，杨尚昆与时任中共中央社会部第二室主任､中央卫戍司令部参谋长的方志纯，谈了迁移中应准备的事项。还约邓典桃就移动的计划､运输力组织､物资处理及人员调动等，作出一系列决定。
在李克农离开西柏坡后，杨尚昆陆续收到了他从北平发来的电报。李克农在北平，同叶剑英､彭真就中央机关进北平后的驻地问题作了几次商讨，他们都认为城内的警卫难度比较大，当时国民党军飞机的作战半径还覆盖着北平，城内防空袭条件也很差，建议先以离北平城区20公里外的香山为中央机关的临时驻地。